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运用CRISPR基因编辑技术

本文为深度编译,暗区仅供交流学习 ,杜克大学不代表智子说观点

杜克大学的研究人员 ,运用CRISPR基因编辑技术 ,究绘在人类基因组的制基“暗区”中 ,发现了一批此前未被识别的因组区突围透视辅助功能DNA片段 。这些神秘的暗区区域,负责调控细胞感知并响应其局部环境物理特性的杜克大学机制。

运用CRISPR基因编辑技术

理解这些DNA序列如何影响细胞的新研身份与功能 ,可能为那些涉及组织物理特性改变的究绘疾病(包括纤维化、癌症、制基中风),因组以及神经退行性疾病 、暗区衰老等长期问题,杜克大学提供新的新研治疗靶点 。该研究已发表于《科学》(Science)期刊。

细胞周围的局部环境 ,对其功能表现以及在不同组织中的发育特性 ,具有关键的暗区突围透视·com作用。我们已经知道 ,激素、细胞因子等信号  ,乃至药物,都能塑造基因的表达。但组织的“硬度”或外部的物理作用力等机械结构 ,是如何影响细胞功能的,至今仍未被完全明晰 。

“细胞微环境中的暗区突围透视脚本机械刺激,是诸多基础细胞过程的强效调控因子 ,包括细胞的生长、死亡 、分化和迁移”,杜克大学生物医学工程系教授 、先进基因组技术中心(CAGT)主任查理·格斯巴赫指出,“我们知道这些物理刺激在组织发育、再生、衰老以及疾病(如纤维化和肿瘤形成)中起着关键作用,推币机无限币单机版但其具体的作用机制,一直难以被理解。”

“人类基因组中,仅有1%至2%的部分负责编码基因。其余98%的基因组,显然在塑造细胞特性、本尊科技环境响应及疾病易感性方面发挥着重要作用,但直到最近,我们才拥有了能够探究这部分‘暗基因组’功能的区突围透视辅助功能工具” ,格斯巴赫的合作者克劳福德教授指出。

为理解细胞感知其机械环境的机制 ,他们的团队制备了能够模拟不同组织硬度的水凝胶,并在这些凝胶上培养细胞 。研究人员随后运用测序工具,绘制出“开放染色质”(即可被访问的DNA)的区域图谱 ,从而确定了在每种硬度的凝胶上,细胞的基因表达与基因组结构所发生的变化 。

“在不同的暗区科技开挂器(免费)凝gel上培养仅20小时后 ,我们就观察到数千个基因的表达水平发生了变化,以及近五万个基因组区域的结构发生了改变”,杜克大学生物医学工程副教授布伦特·霍夫曼表示,“这凸显了机械微环境对细胞生物学的深远影响。”

更具挑战性的 ,是确定“暗基因组”中的哪些变化  ,是通过增强特定基因的活性 ,来影响细胞功能的 。为此,团队运用CRISPR技术 ,系统性地抑制了DNA各个区域的活性 ,并进而评估其对细胞生长和迁移的影响。

那些因局部环境的物理特性而改变其结构、影响了细胞的生长或迁移、并调控了特定基因表达的区域,被研究团队命名为“机械增强子”(mechano-enhancers) ,以体现其调节细胞对环境响应的功能 。

为了进一步解析“机械增强子”的功能及其在疾病中的作用,研究团队证实,在特发性肺纤维化(IPF)这种疾病中 ,这些“机械增强子”正在调控着与该疾病相关的基因活性。

“绘制这些‘机械增强子’的分布图,能深化我们对纤维化和癌症等 、涉及组织力学特性改变的疾病机制的理解 ,并可能为开发新的药物靶点,或通过工程化手段来改变细胞感知病理性机械环境的方法 ,提供依据” ,该研究的博士后研究员布莱恩·科斯格罗夫表示 。

作者信息

米凯拉·马丁内斯(My-kahla Martinez),杜克大学

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